Josy,
Basicamente você terá impactos em Ativos fixos e CO. Não se recomenda modificar dentro do mesmo ano, porém é possível.
verifique esta documentação
http://wiki.scn.sap.com/wiki/display/ERPFI/Fiscal+Year+Variants
Nota Relevante
210861 - Changing fiscal year variant in production system
Att